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2025.11.08

EC運営代行の費用とは?相場から料金体系、費用対効果まで徹底解説

ECサイトを運営する事業者にとって、「EC運営代行の費用」を正確に理解することは、適切な投資判断と予算計画のために不可欠です。

EC運営代行の費用とは、ECサイトの運営業務を専門会社に委託する際に発生するコストであり、プラットフォームや委託する業務範囲、サービス内容により大きく異なります。

適切な費用感を理解することで、予算内で最大限の成果を得られる代行会社を選択し、費用対効果の高いEC運営を実現できます。

本記事では、EC運営代行の一般的な費用相場から、プラットフォーム別の料金目安、料金体系の種類と特徴、費用に影響する要因、費用対効果の考え方、隠れたコストの注意点まで、実践的に解説します。EC運営代行を検討しているがコストが不透明で不安な事業者や、現在の代行費用が適正か判断したい企業にとって、賢い投資判断のための重要な知識が得られる内容となっています。

EC運営代行費用の基本構造

代行費用を理解する前に、費用の基本的な構造を把握しておくことが重要です。

初期費用と月額費用の違い

EC運営代行の費用は、大きく分けて初期費用と月額費用の2つに分類されます。

初期費用は契約開始時に一度だけ発生するもので、アカウント設定や初期分析、商品登録の一括作業などが含まれます。金額は0円から100万円以上まで幅広く、サービス内容や対応するプラットフォームにより大きく異なります。

月額費用は毎月継続的に発生するもので、日々の運営業務や広告運用、レポーティングなどが含まれます。この月額費用が、代行会社との継続的な関係における主要なコストとなります。

3つの料金形態

料金形態として月額固定費型、売上連動型、複合型の3つがあります。

月額固定費型は毎月一定の金額を支払う形式で、予算管理がしやすい特徴があります。売上連動型は売上の一定割合を手数料として支払う形式で、売上が少ない時期は費用負担が軽くなります。複合型は固定費と売上連動を組み合わせたもので、両方のメリットを享受できます。

代行会社によって採用している料金形態が異なるため、自社のビジネスモデルや売上規模に合った形態を選択することが重要です。

プラットフォーム別の費用相場

EC運営代行の費用は、対応するプラットフォームにより相場が異なります。

Amazonの運営代行費用

Amazonの運営代行費用は、月額20万円からが一般的な相場となっています。

Amazonは商品登録が比較的シンプルで、広告運用とページ最適化が中心となるため、他のプラットフォームと比較すると若干低めの設定となっています。小規模事業者向けの部分委託であれば月額10万円程度から対応する代行会社もありますが、包括的なサポートを求める場合は月額30万円から50万円程度が標準的です。

Amazon広告の運用を含む包括的なサポートでは、広告費とは別に月額30万円から50万円程度の運用費が発生することが一般的です。

楽天市場の運営代行費用

楽天市場の運営代行費用は、月額30万円からが相場です。

楽天市場は独自のRMSシステムや複雑な仕様、頻繁なイベント対応が必要なため、他のプラットフォームより費用が高めに設定されています。商品ページの作成もHTMLコーディングが必要で手間がかかることから、包括的なサポートでは月額50万円から100万円程度となることも珍しくありません。

楽天市場は売上規模が大きくなる傾向があるため、費用対効果を考えると妥当な投資と言えます。スーパーセールやお買い物マラソンなどのイベント対応が充実している代行会社ほど、費用は高めになる傾向があります。

Yahoo!ショッピングの運営代行費用

Yahoo!ショッピングの運営代行費用は、月額20万円からが目安となっています。

Yahoo!ショッピングは楽天市場ほど複雑ではないものの、独自の管理画面や広告メニューへの対応が必要です。

包括的なサポートでは月額30万円から60万円程度が一般的です。PayPayモールへの対応も含める場合は、追加で費用が発生することがあります。

自社ECサイトの運営代行費用

自社ECサイトの運営代行費用は、月額30万円からが相場です。また、自社用にカスタマイズしていくので最も追加の費用がかかる可能性が高いです。

自社ECサイトはカートシステムやデザイン、機能が多様で、それぞれに応じたカスタマイズが必要となるため、モールと比較して費用が高くなる傾向があります。システムの種類やカスタマイズの程度により、月額50万円から150万円以上となることもあります。

サイト制作やシステム改修が必要な場合は、別途数十万円から数百万円の費用が発生することもあります。Shopify、BASE、MakeShop、EC-CUBEなど、使用しているカートシステムにより対応できる代行会社も限られるため、選択肢が狭まる可能性があります。

業務範囲別の費用目安

委託する業務範囲により、費用は大きく異なります。

商品ページ制作のみの委託

商品ページ制作のみを委託する場合、1商品あたり5,000円から3万円程度が相場です。

商品撮影が含まれる場合は、撮影費用として別途1商品あたり5,000円から3万円程度が加算されます。

商品ページの品質は売上に直結するため、単価が高くても高品質な制作を選ぶことが最善なこともあります。楽天市場のようにHTMLコーディングが必要なプラットフォームでは、費用が高めになる傾向があります。

広告運用のみの委託

広告運用のみを委託する場合は、月額5万円から20万円程度が一般的です。

これは広告費とは別に発生する運用手数料で、広告費の20%から30%を手数料として設定する売上連動型の代行会社もあります。

広告運用は専門知識が必要で、効果的な運用により広告費用対効果が大きく改善されるため、プロに委託する価値が高い業務です。

カスタマーサポートのみの委託

カスタマーサポートのみを委託する場合、月額5万円から20万円程度が目安です。

対応件数や対応時間により費用が変動し、24時間365日対応が必要な場合はさらに高額となります。メール対応のみであれば比較的低額ですが、電話対応やチャット対応を含む場合は費用が増加します。

ECサイトでは顧客対応の品質が評価やリピート率に直結するため、専門のカスタマーサポートチームを持つ代行会社への委託が効果的です。

在庫管理と物流業務の委託

在庫管理と物流業務を委託する場合は、取り扱う商品数や出荷件数により大きく変動します。

基本的な管理業務で月額5万円から30万円程度、これに加えて出荷件数に応じた従量課金が発生することが一般的です。FBA(フルフィルメント by Amazon)や楽天スーパーロジスティクスなどのプラットフォーム提供の物流サービスを利用する場合は、代行会社の関与が少なくなるため費用も抑えられます。

包括的な運営代行

包括的な運営代行として、商品登録から広告運用、データ分析まですべてを委託する場合は、月額30万円から100万円以上が相場となります。

▼包括委託の費用目安
・小規模事業者(月商500万円未満):月額30万円から50万円
・中規模事業者(月商500万円から3,000万円):月額50万円から100万円
・大規模事業者(月商3,000万円以上):月額100万円から300万円以上

売上規模が大きい企業や複数のプラットフォームを運営している場合は、月額100万円程度となることもあります。包括委託は個別委託と比較して割安になる傾向があり、管理の手間も省けるメリットがあります。

料金体系の詳細と特徴

EC運営代行には主に3つの料金体系があり、それぞれに特徴があります。

月額固定費型

月額固定費型は、毎月一定の金額を支払う最もシンプルな料金体系です。

▼月額固定費型の費用目安
・小規模事業者:月額10万円から30万円程度
・中規模事業者:月額30万円から100万円程度
・大規模事業者:月額100万円以上

▼メリット
・費用が明確で予算管理がしやすい
・売上に関係なく一定のサービスを受けられる
・安定した売上がある企業に適している

▼デメリット
・売上が少ない時期も固定費が発生する
・成果に関係なく費用がかかる

安定した売上がある企業や、予算を明確にコントロールしたい企業に適しています。

売上連動型(成果報酬型)

売上連動型は、売上の一定割合を手数料として支払う成果報酬型の料金体系です。

一般的には売上の5%から20%程度を手数料として設定します。業務範囲が広いほど手数料率が高くなる傾向があり、包括的な運営代行では15%から20%、部分的な業務では5%から10%程度が相場です。

▼メリット
・売上がない時期は費用負担が少ない
・代行会社も売上向上に強い動機を持つ
・初期費用が抑えられる場合が多い

▼デメリット
・売上が増えると費用も増大する
・利益率が低い商品では負担が大きい
・売上の定義や計算方法でトラブルになる可能性がある

売上が不安定な企業や、初期費用を抑えたい企業、代行会社と成果を共有したい企業に適しています。

複合型

複合型は、固定費と売上連動を組み合わせた料金体系です。

たとえば月額固定費20万円に加えて売上の5%を支払う形式などがあります。この体系は固定費と成果報酬のバランスが取れており、代行会社も最低限の収益を確保できるため質の高いサービスが期待できます。

現実的でバランスの取れた料金体系と言えます。固定費部分で基本的な運営をカバーし、売上連動部分で成果に応じた報酬を支払う仕組みにより、双方にとってメリットがあります。

初期費用について

初期費用については、0円から100万円以上まで幅広く設定されています。

▼初期費用に含まれる項目
・アカウント設定や初期分析
・商品登録の一括作業
・サイト構築やデザイン制作
・戦略立案や競合分析

売上連動型の代行会社は初期費用を低く設定する傾向があり、月額固定費型の代行会社は初期費用が高めに設定されることが多いです。自社ECサイトの場合、サイト制作費として数十万円から数百万円の初期費用が発生することもあります。

費用に影響を与える主な要因

EC運営代行の費用は、様々な要因により変動します。

委託する業務範囲

最も大きな影響を与えるのは委託する業務範囲です。

商品登録のみの部分委託と、商品登録から広告運用、カスタマーサポート、データ分析まで含む包括委託では、費用が数倍から十倍以上異なります。業務範囲が広いほど費用は高くなりますが、一般的に包括委託のほうが個別委託の合計よりも割安になる傾向があります。

業務を切り分けて複数の代行会社に委託する場合、それぞれとの連携やコミュニケーションコストも考慮する必要があります。

代行会社の専門性と実績

代行会社の専門性と実績も費用を左右する要因です。

豊富な実績と高い専門性を持つ代行会社は、費用が高めに設定されていますが、効果も高い傾向があります。特定のプラットフォームや業界に特化した代行会社は、専門性の高さから費用が高めになることがあります。

大手の代行会社は組織体制が整っている分、費用が高めですが、安定したサービスが期待できます。一方、中小規模の代行会社やフリーランスは費用が安い傾向がありますが、対応範囲やサポート体制に制約がある場合もあります。

サポート体制の充実度

サポート体制の充実度も費用に反映されます。

専任担当者が配置されるか複数担当制か、定期ミーティングの頻度、レポートの詳細度、緊急時の対応体制などにより費用が変動します。手厚いサポートを求めるほど費用は高くなりますが、コミュニケーションの円滑さと成果に影響します。

週次レポートと月次ミーティングが標準的ですが、より頻繁なコミュニケーションを求める場合は追加費用が発生することがあります。

契約期間

契約期間も費用に影響を与える要因です。

長期契約を結ぶことで、月額費用が割安になるケースがあります。1年契約で月額費用が10%から20%割引になることが一般的です。短期契約や最低契約期間がない場合は、月額費用が高めに設定されることが多いです。

ただし、初めて代行会社を利用する場合は、まず短期契約やトライアル期間で相性を確認してから長期契約に移行することが推奨されます。

費用対効果の考え方

EC運営代行の費用を評価する際は、単純な金額ではなく費用対効果を重視することが重要です。

売上や利益の増加

費用対効果を測る最も基本的な指標は、代行費用に対してどれだけ売上や利益が増加したかです。

たとえば月額30万円の代行費用で月商が200万円増加し、利益率が20%であれば、増加利益は40万円となり、代行費用を差し引いても10万円の純利益増加となります。この場合、費用対効果は明確にプラスと言えます。

単純に「代行費用が高い」と判断するのではなく、その費用に対してどれだけのリターンが得られるかを評価することが重要です。

広告効率の改善

広告運用代行の場合は、ROAS(広告費用対効果)やACoS(売上高広告費比率)の改善が重要な指標となります。

自社で運用していた時にACoSが30%だったものが、代行会社に委託して15%に改善されれば、広告効率が2倍になったことを意味します。売上額にもよりますが運用手数料を支払っても、全体としての費用対効果は大幅に向上するケースはあります。

時間的コストの削減

時間的なコストの削減も重要な要素です。

EC運営には膨大な時間と労力が必要で、商品登録、在庫管理、カスタマーサポート、データ分析などに社内リソースを割くことで、本業や商品開発に集中できなくなります。代行会社に委託することで、経営者や社員さんが本来の業務に集中でき、そこから生まれる価値を考慮すると、代行費用は十分に正当化されます。

たとえば、経営者が月に50時間をEC運営に費やしていた場合、その時間を商品開発や新規事業に使えることで生まれる価値は、代行費用を大きく上回る可能性があります。

機会損失の回避

機会損失の回避という観点も重要です。

専門知識がないために最適な施策を実行できず、本来得られたはずの売上を逃している可能性があります。プロの代行会社に委託することで、これらの機会損失を回避でき、結果的に大きなリターンが得られます。

▼機会損失の例
・効果的な広告運用ができず、売上機会を逃している
・商品ページの品質が低く、コンバージョン率が低い
・在庫切れが頻発し、販売機会を失っている
・競合の動向に気づかず、市場シェアを失っている

これらの機会損失を金額換算すると、代行費用を大きく上回ることが多いです。

長期的な成長への投資

長期的な成長への投資という視点も忘れてはいけません。

代行会社から得られるノウハウや戦略的なアドバイスは、将来的な事業成長の基盤となります。短期的な費用だけでなく、中長期的な成長への投資として捉えることが重要です。

初期段階では代行費用が利益を圧迫することもありますが、売上が拡大し、運営が安定してくると、費用対効果は大幅に改善される傾向があります。6ヶ月から1年程度で投資回収できるケースが多く、その後は継続的に利益を生み出します。

隠れたコストと注意点

EC運営代行を利用する際は、明示されている費用以外にも注意すべきコストがあります。

追加費用が発生する条件

追加費用が発生する条件を事前に確認することが重要です。

▼確認すべき追加費用の項目
・追加業務発生時の費用
・商品数や注文数が想定を超えた場合の追加料金
・緊急対応やイレギュラー対応の費用
・外部ツールやサービスの費用
・データ移行や引き継ぎの費用

契約時に明示された月額費用や手数料以外に、これらの条件を契約前に明確にしておかないと、予想外のコストが発生してトラブルになります。特に、「商品数100点まで月額30万円、以降1点追加ごとに5,000円」のような従量課金の条件は必ず確認が必要です。

解約時のコスト

解約時のコストにも注意が必要です。

最低契約期間内に解約する場合の違約金、データやアカウントの引き継ぎにかかる費用、引き継ぎ期間中のサポート費用などが発生することがあります。将来的に代行会社を変更する可能性も考慮し、解約条件を事前に確認しておくことが賢明です。

一般的には、3ヶ月から6ヶ月前の解約通知が必要で、最低契約期間は6ヶ月から1年程度が多いです。

広告費は別途必要

広告費は代行費用とは別に発生する点にも留意が必要です。

広告運用代行の費用は運用手数料のみで、実際の広告出稿費用は別途必要です。広告費の規模により全体のコストが大きく変わるため、代行費用と広告費の合計で予算を考える必要があります。

たとえば、月額20万円の運用代行費用に加えて、売上の10%から15%の広告費が必要になることが一般的です。

外部ツールやサービスの費用

外部ツールやサービスの費用も見落としがちです。

分析ツール、在庫管理システム、撮影スタジオなど、代行業務に必要な外部サービスの費用が別途発生する場合があります。これらが代行費用に含まれているか、別途必要かを確認することが重要です。

特に、高度なデータ分析を行う場合、月額数万円から数十万円の分析ツール費用が別途必要になることがあります。

費用を抑えるためのポイント

EC運営代行の費用を適正に抑えながら、効果を最大化するためのポイントがあります。

必要な業務のみを委託する

まず、必要な業務のみを委託することが基本です。

すべてを包括的に委託するのではなく、自社で対応できる業務は残し、専門性が必要な業務や負担の大きい業務のみを委託することで費用を抑えられます。たとえば、商品知識が必要なカスタマーサポートは自社で行い、広告運用のみを委託するなどの選択肢があります。

自社の強みと弱みを分析し、弱みを補完する形で代行会社を活用することが効果的です。

段階的な委託

段階的な委託も有効な戦略です。

最初は最小限の業務から始め、効果を確認しながら徐々に委託範囲を拡大することで、リスクとコストを抑えられます。いきなり大規模な契約をするのではなく、トライアル期間を活用して相性や効果を確認してから本契約に進むことも賢明です。

複数社の見積もりを取る

複数社の見積もりを比較することも重要です。

同じ業務内容でも代行会社により費用が大きく異なる場合があります。サービス内容と費用を総合的に比較検討することで、適正な費用感を把握できます。

ただし、安さだけで選ぶと質の低いサービスを受けるリスクがあるため、費用対効果を重視した判断が必要です。見積もり内容の詳細を比較し、何が含まれていて何が含まれていないかを明確にすることが重要です。

自社でできる準備を整える

自社でできる準備を整えることも費用削減につながります。

▼自社で事前準備できること
・自社でできること、できないことの整理

・商品情報や画像素材の整理


・過去のデータや実績の整理

代行会社の作業を減らすことで初期費用や月額費用を抑えられる場合があります。特に初期費用は、自社での準備状況により大きく変動するため、できる限りの準備をしてから契約することが推奨されます。

まとめ

EC運営代行の費用は、プラットフォームや業務範囲、サービス内容により大きく異なります。Amazonは月額20万円から、楽天市場は月額30万円から、Yahoo!ショッピングは月額20万円から、自社ECサイトは月額30万円からが一般的な相場ですが、実際の費用は個別の状況により変動します。

重要なのは、費用対効果を重視して判断することです。代行会社に委託することで得られる売上増加、時間的コストの削減、機会損失の回避、長期的な成長への投資という価値を総合的に評価する必要があります。

料金体系は月額固定費型、売上連動型、複合型があり、自社のビジネスモデルや売上規模に合った形態を選択することが重要です。株式会社PICでは、楽天市場、Amazon、Yahoo!ショッピング、自社ECサイトなど、主要プラットフォームに対応した柔軟な料金プランを提供しています。お客様の予算や目標に応じて、最適なサービスプランをご提案いたします。

EC運営代行の費用や具体的なプランについてご相談されたい事業者様は、ぜひお気軽にお問い合わせください。透明性の高い料金体系と費用対効果を重視したサポートにより、貴社のEC事業の成長を確実に支援いたします。